艾滋病防制科作为东莞市疾控中心的主要职能科室之一，目前共有专业技术人员7名，其中副主任医师以上职称3名，医师4名。其主要职能是在艾滋病防治条例规定的职能范围内负责东莞市辖区范围内艾滋病疫情的监测和处理及病例资料的收集工作，开展艾滋病高危行为干预和自愿咨询检测工作、配合国家和省完成艾滋病防制项目工作等。艾滋病防制科的成立标志着东莞市的艾滋病防制工作又上了一个新的台阶，进一步健全了我市艾滋病防制工作平台，对全市的艾滋病防制工作将产生积极的带动作用。
市疾控中心领导高度重视艾滋病防制科的工作，中心刘志权主任出席艾滋病的防制科首次会议并指出艾滋病防制科的特点是：“人不多、素质高；科室新、意义大；项目小、经费足；困难多、目标明”，要求艾滋病防制科要以“团结、务实、敢创、敢干”的精神为东莞市的艾滋病防制工作做出贡献。
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