腹泻病毒的实验室诊断方法多样，一般可以分为电镜法、病毒分离培养法、免疫学方法和分子生物学方法。市疾控中心微检所现时检测的腹泻病毒种类包括诺如病毒、轮状病毒、肠道腺病毒和星状病毒。
一、电镜法
电镜法包括直接电镜和免疫电镜检查。各种腹泻病毒被发现后很长一段时间内，电镜技术一直是检测的主要手段，具有直接、可靠的优点。但由于有些腹泻病毒在电镜下缺乏显著的形态学特征，如诺如病毒，故敏感性低。若在标本中加入荧光标志的抗体，可提高检出率，称为免疫电镜法。但当病毒滴度低时，仍有较高的假阴性，且价格昂贵、技术条件要求高，因此无法应用于大规模的流行病学调查。
二、病毒分离培养技术
病毒分离培养技术是病毒传统鉴定的金标准。但不同病毒对细胞的敏感性不同，因此不可能只用一种细胞分离出各种腹泻病毒。标本中常由于病毒滴度低，部分肠道病毒在单层细胞中不能生长或生长很差或难以生长但不出现细胞病理效应（如诺如病毒目前没有合适的细胞体系和动物模型进行培养），以及标本送检和处理过程延迟造成标本中病毒死亡等原因，使阳性率降低。可见，病毒分离培养鉴定方法繁琐、费力、费用高、敏感性低，不便在临床中常规进行，尤其是病毒分离一般需要1～2周，不适合临床早期诊断和疫情应急诊断的需要，难以达到暴发流行时快速检测鉴定的要求。
三、免疫学方法
（一）中和试验
是检测病毒的经典方法之一。首先，分离出病毒，将其与病毒组合血清进行中和试验，再将其与某一型特异性血清进行中和试验来确认病毒型别。但该方法繁琐、费力，易受多种因素影响导致无法鉴定，甚至得出错误的分型结果。
（二）酶联免疫吸附试验
该法检测腹泻病毒特异性IgM或IgG抗体，特异性高、操作简便、费用低、省时，常用于回顾性诊断，也可用于暴发流行时的调查研究。但其敏感性较低，加之病毒血清型多，给临床检测带来不便。市疾控中心微检所如今采用此方法检测轮状病毒的抗原。
（三）间接免疫荧光法
该法操作简便、快速，用单克隆抗体间接免疫荧光法不但可快速检测腹泻病毒，还可鉴别不同型别的感染。但此方法也会因为交叉反应而出现假阳性或错误的分型结果，使其特异性受到影响。
（四）分子生物学检测
1．核酸杂交法
基于各型腹泻病毒基因存在的同源性，单独一种探针或混合两种探针均可检测出多型病毒，还可设计型特异性探针检测相应型别。该方法特异性较高，但其敏感性会因标本中病毒的滴度较低或探针与被检测病毒的同源性较小而受到影响，通常不适用于直接检测滴度较低的临床标本中的病毒。
2．聚合酶链反应PCR技术及衍生技术
利用各型病毒的基因组序列设计引物，PCR法检测腹泻病毒。对PCR扩增产物进行序列分析，还可对病毒进一步分型。该方法检测快速、敏感、特异，是目前较理想的诊断技术。诺如病毒尚不能在细胞培养，而且感染后粪便样本中带毒量少，排毒时间短，而病毒抗原性和基因组核酸序列呈高度多样性，所以RT-PCR法是目前检测诺如病毒最敏感、应用最广泛的方法。市疾控中心微检所主要应用实时荧光RT-PCR技术进行腹泻病毒核酸的检测和分型。
RT-PCR也是有效检测星状病毒的方法。Matsui等设计了7对星状病毒血清特异性引物。采用RT-PCR法对星状病毒进行分型研究，使星状病毒流行病学研究更加迅速、简便。
腺病毒为DNA病毒，应用PCR技术可将F-亚属腺病毒从其他腺病毒中鉴别出来。应用PCR结合RFLP，即将腺病毒的特定序列用PCR扩增后，其产物再用限制性内切酶进行酶切图谱分析。这种方法分辨率高、重复性好、简单快速。
3．核酸序列依赖性扩增技术
目前在国外已用核酸序列依赖性扩增（NASBA）技术检测一些腹泻病毒。NASBA的最大特点是可直接扩增特异性的单链RNA，不需特殊仪器，反应在42℃恒温下进行，可以在2h内将模板RNA扩增109倍，比常规PCR法高103倍，并且不会受到外来双链DNA的干扰。
一、电镜法
电镜法包括直接电镜和免疫电镜检查。各种腹泻病毒被发现后很长一段时间内，电镜技术一直是检测的主要手段，具有直接、可靠的优点。但由于有些腹泻病毒在电镜下缺乏显著的形态学特征，如诺如病毒，故敏感性低。若在标本中加入荧光标志的抗体，可提高检出率，称为免疫电镜法。但当病毒滴度低时，仍有较高的假阴性，且价格昂贵、技术条件要求高，因此无法应用于大规模的流行病学调查。
二、病毒分离培养技术
病毒分离培养技术是病毒传统鉴定的金标准。但不同病毒对细胞的敏感性不同，因此不可能只用一种细胞分离出各种腹泻病毒。标本中常由于病毒滴度低，部分肠道病毒在单层细胞中不能生长或生长很差或难以生长但不出现细胞病理效应（如诺如病毒目前没有合适的细胞体系和动物模型进行培养），以及标本送检和处理过程延迟造成标本中病毒死亡等原因，使阳性率降低。可见，病毒分离培养鉴定方法繁琐、费力、费用高、敏感性低，不便在临床中常规进行，尤其是病毒分离一般需要1～2周，不适合临床早期诊断和疫情应急诊断的需要，难以达到暴发流行时快速检测鉴定的要求。
三、免疫学方法
（一）中和试验
是检测病毒的经典方法之一。首先，分离出病毒，将其与病毒组合血清进行中和试验，再将其与某一型特异性血清进行中和试验来确认病毒型别。但该方法繁琐、费力，易受多种因素影响导致无法鉴定，甚至得出错误的分型结果。
（二）酶联免疫吸附试验
该法检测腹泻病毒特异性IgM或IgG抗体，特异性高、操作简便、费用低、省时，常用于回顾性诊断，也可用于暴发流行时的调查研究。但其敏感性较低，加之病毒血清型多，给临床检测带来不便。市疾控中心微检所如今采用此方法检测轮状病毒的抗原。
（三）间接免疫荧光法
该法操作简便、快速，用单克隆抗体间接免疫荧光法不但可快速检测腹泻病毒，还可鉴别不同型别的感染。但此方法也会因为交叉反应而出现假阳性或错误的分型结果，使其特异性受到影响。
（四）分子生物学检测
1．核酸杂交法
基于各型腹泻病毒基因存在的同源性，单独一种探针或混合两种探针均可检测出多型病毒，还可设计型特异性探针检测相应型别。该方法特异性较高，但其敏感性会因标本中病毒的滴度较低或探针与被检测病毒的同源性较小而受到影响，通常不适用于直接检测滴度较低的临床标本中的病毒。
2．聚合酶链反应PCR技术及衍生技术
利用各型病毒的基因组序列设计引物，PCR法检测腹泻病毒。对PCR扩增产物进行序列分析，还可对病毒进一步分型。该方法检测快速、敏感、特异，是目前较理想的诊断技术。诺如病毒尚不能在细胞培养，而且感染后粪便样本中带毒量少，排毒时间短，而病毒抗原性和基因组核酸序列呈高度多样性，所以RT-PCR法是目前检测诺如病毒最敏感、应用最广泛的方法。市疾控中心微检所主要应用实时荧光RT-PCR技术进行腹泻病毒核酸的检测和分型。
RT-PCR也是有效检测星状病毒的方法。Matsui等设计了7对星状病毒血清特异性引物。采用RT-PCR法对星状病毒进行分型研究，使星状病毒流行病学研究更加迅速、简便。
腺病毒为DNA病毒，应用PCR技术可将F-亚属腺病毒从其他腺病毒中鉴别出来。应用PCR结合RFLP，即将腺病毒的特定序列用PCR扩增后，其产物再用限制性内切酶进行酶切图谱分析。这种方法分辨率高、重复性好、简单快速。
3．核酸序列依赖性扩增技术
目前在国外已用核酸序列依赖性扩增（NASBA）技术检测一些腹泻病毒。NASBA的最大特点是可直接扩增特异性的单链RNA，不需特殊仪器，反应在42℃恒温下进行，可以在2h内将模板RNA扩增109倍，比常规PCR法高103倍，并且不会受到外来双链DNA的干扰。
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