2016年12月，国家对既往2008版的免疫程序进行细微的调整，并发布了最新版的儿童免疫接种程序。调整内容如下：
　　一、明确起始免疫年（月）龄要求
　　对比既往的免疫程序，2016版最新的儿童免疫程序明确了各类疫苗的起始免疫年（月）龄，即，可以接种该剂次疫苗的最小接种年（月）龄。
　　（一）百白破疫苗
　　既往2008版的免疫程序为“接种4剂次，儿童3月龄、4月龄、5月龄和18~24月龄各接种1剂次”，2016版的免疫程序变更为“共4剂次，分别于3月龄、4月龄、5月龄、18月龄各接种1剂”。
　　（二）麻腮风疫苗
　　既往2008版的免疫程序为“儿童18~24月龄时接种1剂次麻腮风疫苗”，2016版的免疫程序变更为“18月龄接种1剂次”。
　　（三）A群流脑疫苗
　　既往2008版的免疫程序为“接种2剂次，儿童6~18月龄时接种2剂次，接种间隔为3个月”，2016版的免疫程序变更为“接种2剂次，分别于6月龄、9月龄各接种1剂次”。
　　具体免疫接种程序详见下表。

国家免疫规划疫苗儿童免疫程序表（2016年）

　　二、增加两种疫苗的免疫程序
　　对比2008版《国家免疫规划疫苗免疫程序》，2016年版的《国家免疫规划疫苗儿童免疫程序表》增加了乙脑灭活疫苗、甲肝灭活疫苗的免疫程序。
　　（一）乙脑灭活疫苗
　　共接种4剂次。8月龄接种2剂，间隔7~10天；2周岁和6周岁各接种1剂。
　　（二）甲肝灭活疫苗
　　共接种2剂次，18月龄接和24月龄各接种1剂。
　　三、完成疫苗接种时间建议
　　儿童年（月）龄达到相应疫苗的起始接种年（月）龄时，应尽早接种，建议在下述推荐的年龄之前完成国家免疫规划疫苗相应剂次的接种。
　　（一）出生后24小时内完成接种的疫苗：乙肝疫苗第1剂。
　　（二）3月龄之前完成接种的疫苗：卡介苗。
　　（三）12月龄之前完成接种的疫苗：第3剂的乙肝疫苗、第3剂的脊灰疫苗、第3剂的百白破疫苗、麻风疫苗、第1剂的乙脑减毒活疫苗或第2剂的乙脑灭活疫苗。
　　（四）18月龄之前完成接种的疫苗：第2剂的A群流脑多糖疫苗。
　　（五）24月龄之前完成接种的疫苗：麻腮风疫苗、甲肝减毒活疫苗或第1剂甲肝灭活疫苗、第4剂百白破疫苗。
　　（六）3周岁之前完成接种的疫苗：第2剂乙脑减毒活疫苗或第3剂乙脑灭活疫苗、第2剂甲肝灭活疫苗。
　　（七）4周岁之前完成接种的疫苗：第1剂的A群C群流脑多糖疫苗。
　　（八）5周岁之前完成接种的疫苗：第4剂的脊灰疫苗。
　　（九）7周岁之前完成接种的疫苗：白破疫苗、第2剂的A群C群流脑多糖疫苗、第4剂的乙脑灭活疫苗。
　　未按照推荐年龄完成国家免疫规划规定剂次接种的14岁以下儿童，应尽早补种。